В первую очередь при системном анализе исследуют параметры «...»? Варианты: входа; выхода; процесса.

При системном анализе в первую очередь исследуют параметры входа системы, поскольку именно входные воздействия определяют её дальнейшее функционирование и результат.

Ответ: входа.