Ответ:

Перед противительным союзом «а» между частями сложного предложения ставится запятая. Однородные члены «архив» и «лаборатория» разделяются запятой. Во втором предложении запятая ставится перед союзом «а», соединяющим части сложного предложения.

Сегодня в Наклонной башне города Невьянска Свердловской области находится филиал историко-архитектурного музея, а раньше в ней располагались заводской архив, лаборатория и рабочий кабинет промышленника-предпринимателя Акинфия Демидова. Он построил в этих местах каменный дом для своей семьи, а рядом с деревянной Преображенской церковью возвёл башню-колокольню с девятью мини-этажами.

Ответ: 2, 3, 6.