Здесь нужен Present Simple, так как это вопрос о регулярном действии. Вопрос начинается с 'What time', и нужно использовать вспомогательный глагол 'do' для местоимения 'you'. Поэтому правильный вариант: Do you go.
Перевод: Во сколько ты ходишь в школу?