When I ... it ... yesterday.

Решение:

Для правильного выбора необходимо учитывать грамматическое время и контекст предложения. Предложение описывает действие, произошедшее вчера. В английском языке для описания однократного действия в прошлом используется Past Simple.

1. wake up, was raining — Неправильный глагол 'wake' в Present Simple и продолжающееся действие 'was raining' в Past Continuous.
2. woke up, was raining — Правильный глагол 'wake' в Past Simple ('woke up') и продолжающееся действие 'was raining' в Past Continuous. Эта комбинация подходит для описания ситуации, когда одно действие (пробуждение) произошло во время другого, продолжавшегося действия (дождя).
3. woke up, rained — Правильный глагол 'wake' в Past Simple ('woke up') и простое прошедшее действие 'rained' в Past Simple. Эта комбинация также грамматически верна, но 'woke up, was raining' лучше передает одновременность двух действий вчера.

В данном случае, наиболее естественным и часто используемым вариантом для описания ситуации, когда одно действие произошло на фоне другого, является выбор Past Simple для первого действия и Past Continuous для второго.

When I woke up, it was raining yesterday.

Ответ: woke up, was raining