You are (Ты есть) — Глагол 'to be' во 2-м лице единственного или множественного числа.
The weather is (Погода есть) — Глагол 'to be' в 3-м лице единственного числа для неодушевлённых предметов.
three years old? (три года?) — Здесь пропущено местоимение, которое можно восстановить, например, как 'He is' или 'She is'. Но без контекста, предполагается, что речь идет о третьем лице единственного числа.