Ответ:

  1. В библиотеке не хватало двух книг. С существительным «книг» употребляется количественное числительное «два» в родительном падеже.
  2. Он был в рейсе четверо суток. С существительным «сутки», употребляющимся только во множественном числе, используется собирательное числительное.
  3. Купи, пожалуйста, пять батонов. С названием неодушевлённых предметов употребляется количественное числительное.
  4. По двору бегали четверо цыплят. Собирательное числительное сочетается с названиями детёнышей животных.
  5. Три девочки опоздали на урок. С существительными женского рода обычно употребляются количественные числительные.
  6. Два солдата отдал свой рюкзак товарищу. Существительное «солдат» обозначает лицо мужского пола; здесь требуется количественное числительное.