⑤ На воде мелькая подра 3 кол тени от набегавших туч 5

Выполним синтаксический разбор предложения.

1. Тени мелькали - грамматическая основа.
2. Предложение простое.
3. В предложении есть обособленное обстоятельство, выраженное деепричастным оборотом мелькая в воде.
4. Определение подрагивающие, набегавшие являются однородными, соединенными союзом и, запятая не ставится.

Пунктуация:

На воде, мелькая, подрагивающие тени от набегавших туч.

Ответ: На воде, мелькая, подрагивающие тени от набегавших туч.