Краткое пояснение:
Запятая разделяет простые предложения в составе сложносочиненного или сложноподчиненного. Во втором предложении запятая разделяет однородные сказуемые. В третьем предложении запятая разделяет однородные члены предложения, связанные союзом 'но'.
Ответ: Капитан не находил изъянов в обороне, но тревога не проходила.