Ответ:

1) Неверно: в первой части предложения грамматическая основа «биология подвергается», во второй — «проблемы приобретают». Сочетания «биология и проблемы» как подлежащего нет.

2) Верно: «методы разрабатывались».

3) Верно: «убеждение возникло».

4) Неверно: грамматическая основа главной части — «предположение рождается»; слова «проникнуть в ядро» входят в придаточную часть.

5) Верно: «он остаётся».

Ответ: 2, 3, 5.