Ответ:
1) Неверно: в первой части предложения грамматическая основа «биология подвергается», во второй — «проблемы приобретают». Сочетания «биология и проблемы» как подлежащего нет.
2) Верно: «методы разрабатывались».
3) Верно: «убеждение возникло».
4) Неверно: грамматическая основа главной части — «предположение рождается»; слова «проникнуть в ядро» входят в придаточную часть.
5) Верно: «он остаётся».
Ответ: 2, 3, 5.
