2) Беспокойно ворочался в своей клетке попугай да доносилось мерное постукивание стенных часов из Поликарповой комнаты во всём же остальном царили мир и тишина (Ч.).

Предложение: Беспокойно ворочался в своей клетке попугай, да доносилось мерное постукивание стенных часов из Поликарповой комнаты, во всём же остальном царили мир и тишина (Ч.).

Запятые разделяют три части сложного предложения. Союз «да» здесь употреблён в значении «и».

Схема: [=], да [=], [=].