Ответ:
Это обмен репликами: «Вы не знали?» — «Не знал, конечно».
Вопрос содержит отрицание, но по смыслу спрашивающий уточняет, было ли собеседнику известно, что клиника платная. Ответ «Не знал» сообщает об отсутствии знания до этого момента, поэтому он естественен. Здесь прошедшее время глагола «знал» обозначает состояние, актуальное до момента разговора; из контекста также понятно, что теперь собеседник узнал об оплате.
