Ответ:

  1. В течение всего дня мама не разговаривала со мной. «В течение» обозначает время; НЕ с глаголом пишется раздельно.
  2. В следствии по уголовному делу появились новые материалы. Речь идёт о расследовании; это существительное с предлогом.
  3. Ученые изучают Арктику в продолжение нескольких десятилетий. «В продолжение» обозначает период времени, «нескольких» пишется с НЕ слитно.
  4. Дунай в нижнем течении замерзает зимой почти на полтора месяца. Это существительное: в нижнем течении реки.
  5. Вследствие оледенения самолет начал терять высоту. Производный предлог имеет значение «из-за».
  6. Я имел в виду совсем другое средство. Сочетание «иметь в виду» пишется раздельно.