Ответ:

Слова «а не с бумажками возиться» противопоставлены первой части с помощью союза «а», поэтому перед союзом ставится запятая. Прямая речь стоит перед словами автора и отделяется тире.

«Я командовать приехал, а не с бумажками возиться», — заявил Чапаев.