Запятые нужно поставить на месте цифр 1 и 2.
Разберем предложение: «К Марье Афанасьевне я не пошёл, а закрыв кухню на чёрный висячий замочек выбежал во двор».
Деепричастный оборот - «закрыв кухню» - выделяется запятыми с двух сторон, если стоит в середине предложения. Так как он стоит в середине предложения, то он должен быть выделен запятыми. Соответственно, перед «закрыв кухню» нужна запятая (позиция 1), и после (позиция 2). Цифра 3 не нужна, так как она внутри деепричастного оборота.