3. Я думал, что(бы) мне сказать отцу, что(бы) он успокоился.

3. Я думал, что бы мне сказать отцу, чтобы он успокоился.

Объяснение:

• Первое что бы — вопросительное местоимение с частицей бы, можно задать вопрос «что именно бы».
• Второе чтобы — союз, выражает цель действия (чтобы он успокоился).