Сходство: оба являются экосистемами с производителями, потребителями и разрушителями, где происходят пищевые цепи.
Различия: аквариум - искусственная, замкнутая система с ограниченным видовым разнообразием и контролируемыми факторами; естественный водоём - природная, открытая система с большим биоразнообразием и естественными процессами.