Ответ:

Музей льна и берёсты в Костроме — один из тех музеев, которые можно найти только в таких старых городах. Примечательно, что берёста и лён кажутся не слишком родственными материалами, но, если вспомнить, что наши далёкие предки носили в основном льняную одежду, а лапти долго были на Руси единственным общедоступным видом лёгкой обуви, становится понятно, почему лён и берёста соседствуют в одном музее.

Пояснение: (1) тире между подлежащим и сказуемым; запятые (2), (3), (6), (8) отделяют придаточные части; (4) разделяет части сложносочинённого предложения; (5) и (7) выделяют придаточную часть «если вспомнить…»; (9) отделяет придаточное изъяснительное.

Ответ: запятые ставятся на местах цифр 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9.