Ответ:

Оборот «обусловленная комплексом факторов…» стоит после определяемого слова «структура» и обособляется. Оборот «связанных со спецификой научного мышления» относится к слову «факторов» и отделяется запятыми.

Структура научного произведения, обусловленная комплексом факторов, связанных со спецификой научного мышления, отличается от организации публицистического текста.