Ответ:

Запятая (1) разделяет части сложного предложения, соединённые союзом «и». Запятая (2) закрывает придаточную часть времени «по мере того как свет месяца становился ярче». Между однородными сказуемыми «делались короче и чернее» запятая (3) не ставится.

Ответ: 1, 2.