B: I know. She **had been studying** for a history exam all day.
**Объяснение:** Здесь нужно использовать Past Perfect Continuous, так как действие (занималась) длилось в течение определенного времени в прошлом (весь день) и повлияло на её состояние (была измучена).
В форме Past Perfect Continuous используется вспомогательный глагол "had", форма глагола "be" в виде "been" и основной глагол с окончанием "-ing". Таким образом, правильная форма глагола "study" - "had been studying".