Для того чтобы правильно составить вопрос, необходимо определить, какое существительное исчисляемое или неисчисляемое. Если существительное неисчисляемое, то используем How much, если исчисляемое, то How many. Существительное boys (мальчики) - исчисляемое, поэтому вопрос будет начинаться с How many.
Ответ: How many boys are there in the room?