c. It was raining the whole day yesterday.
В Past Continuous (прошедшем продолженном времени) глагол "to rain" (идти о дожде) принимает форму "was raining", так как речь идет о действии, длившемся в определенный период в прошлом (весь день вчера шел дождь).
Ответ: was raining