Основные отличия папоротников от мхов:
- Наличие сосудистой системы (ксилемы и флоэмы) у папоротников, что позволяет им достигать больших размеров. У мхов нет настоящей сосудистой системы.
- Папоротники имеют настоящие корни, стебли и листья (вайи), в то время как мхи имеют ризоиды, стебельки и листья.
- У папоротников преобладает спорофит (бесполое поколение), а у мхов - гаметофит (половое поколение).
- Оплодотворение у папоротников происходит только при наличии воды, также, как и у мхов.