В световой микроскоп обычно можно увидеть ядро, цитоплазму, клеточную мембрану, митохондрии и хлоропласты (в растительных клетках). Более мелкие структуры, такие как рибосомы, лизосомы, эндоплазматическую сеть и комплекс Гольджи, можно увидеть только с помощью электронного микроскопа из-за его более высокого разрешения.