3. Можно ли назвать гены, определяющие цвет семян гороха, и гены, определяющие цвет венчика цветков гороха, аллельными?

Да, гены, определяющие цвет семян гороха, и гены, определяющие цвет венчика цветков гороха, можно назвать аллельными, если они находятся в одних и тех же локусах (местах) гомологичных хромосом и отвечают за альтернативные варианты одного и того же признака (в данном случае, цвета).