Раскроем скобки и запишем слово «мягкий» в соответствующей форме, применяя протокол Е.
Древесина у липы мягче, чем у дуба.
В сравнительной степени прилагательные образуются при помощи суффиксов -е, -ее, -ей или путем прибавления слов «более», «менее».
Ответ: Древесина у липы мягче, чем у дуба.