Размеры и внешний вид: Плауны обычно меньше папоротников. Плауны часто имеют стелющиеся или прямостоячие стебли с мелкими, чешуевидными листьями, в то время как папоротники могут быть крупными растениями с большими, перисто-рассечёнными листьями (вайями).
Размножение: У плаунов спорангии (органы, в которых образуются споры) располагаются в стробилах (специализированных структурах на концах побегов или в пазухах листьев). У папоротников спорангии чаще всего находятся на нижней стороне листьев, образуя группы, называемые сорусами.
Распространение: Плауны часто встречаются в хвойных лесах и на болотах, в то время как папоротники распространены в более разнообразных средах, включая леса, скалы и водные местообитания.
Стебель: Стебель плауна покрыт мелкими листьями, расположенными спирально, в то время как у папоротников листья (вайи) крупнее и имеют перистое строение.