Применим протокол Б (пунктуация).
Долго не заходящее солнце катилось над самым гребнем хребта, тускло светя сквозь пелену туч и окрашивая их в красноватый цвет.
В данном предложении есть деепричастные обороты: тускло светя сквозь пелену туч и окрашивая их в красноватый цвет.
Деепричастный оборот "тускло светя сквозь пелену туч" относится к слову катилось, поэтому выделяется запятыми с двух сторон.
Деепричастный оборот "окрашивая их в красноватый цвет" относится к слову катилось, поэтому выделяется запятыми с двух сторон.
Но между этими деепричастными оборотами стоит союз "и".
Если два деепричастных оборота связаны союзом "и", то между ними запятая не ставится.
Таким образом, запятая ставится только в позиции 1 и 2.
Ответ: 1, 2