9. Укажите цифру(-ы), на месте которой (-ых) должна(-ы) стоять запятая (-ые). Сначала Иван Петрович молчал (1) и крепился (2) но (3) когда отец вздумал грозить ему постыдным наказаньем (4) он не вытерпел.

Запятые должны стоять после цифр 2 и 3. Перед союзом "но", соединяющим две части сложносочиненного предложения, ставится запятая. Также, внутри второй части сложносочиненного предложения, перед подчинительным союзом "когда" ставится запятая. Таким образом, ответ: 2, 3