В русском языке «НЕ» с разными частями речи имеет свои особенности написания. Важно определить, к какой части речи относится слово, и есть ли противопоставление или другие условия для раздельного написания.
Правильный ответ — предложение №3:
3. В нашем пруду рыба водится (не)крупная, а мелкая.
В этом предложении есть противопоставление с союзом «а», что требует раздельного написания «не» с прилагательным.