В небе кричат пролетающие косяком и прощающиеся с летом журавли. В небе кричат журавли пролетающие косяком и прощающиеся с летом.

В первом предложении причастные обороты стоят перед определяемым словом, поэтому запятые не нужны. Во втором они стоят после слова «журавли» и обособляются; однородные обороты соединены союзом «и».

В небе кричат пролетающие косяком и прощающиеся с летом журавли.

В небе кричат журавли, пролетающие косяком и прощающиеся с летом.