Как правило, автономное существование организмов, образующих тело лишайника (гриба и водоросли), невозможно или затруднено.
Гриб, как правило, не может существовать самостоятельно, так как он не способен к фотосинтезу и нуждается в органических веществах, производимых водорослью. Водоросль же, хотя и способна к самостоятельному фотосинтезу, часто оказывается более уязвимой к внешним условиям (высыханию, перепадам температур) без защиты гриба.
В некоторых случаях водоросли и грибы могут существовать отдельно, но в составе лишайника они образуют более устойчивую и жизнеспособную систему.