2. Необходимо образовать Past Perfect tense (прошедшее совершенное время) от глагола "do" в вопросительной форме. Past Perfect образуется с помощью had + Past Participle (3-я форма глагола). В вопросе had выносится в начало предложения.
Получаем: What had you done by 6 p.m. yesterday?
Ответ: What had you done by 6 p.m. yesterday?