Продукты обмена веществ, такие как аммиак и другие отходы клеточной активности, удаляются у гидры через всю поверхность её тела. Клетки эктодермального слоя избавляются от этих веществ, выделяя их напрямую в окружающую водную среду. В то же время, клетки внутреннего слоя, выстилающие гастральную полость, направляют отходы сначала в эту полость, откуда они впоследствии выводятся наружу.