Ответ:

Пусть в первой коробке было \(x\) карандашей. Тогда во второй было \(39-x\).

После перекладывания в первой коробке станет \(x-5\), а во второй — \(39-x+5=44-x\).

По условию во второй коробке станет на 9 карандашей больше:

\(44-x=(x-5)+9\).

\(44-x=x+4\),
\(40=2x\),
\(x=20\).

Во второй коробке было: \(39-20=19\) карандашей.

Проверка: после перекладывания в коробках будет 15 и 24 карандаша; \(24-15=9\).

Ответ: в первой коробке было 20 карандашей, во второй — 19.