2) Соболько остановился в раздумье обнюхал мои охотничьи сапоги и виновато завилял хвостом.

Сказуемые «остановился», «обнюхал» и «завилял» однородные. Между первыми двумя, не соединёнными союзом, ставится запятая; перед одиночным союзом «и» запятая не нужна.

2) Соболько остановился в раздумье, обнюхал мои охотничьи сапоги и виновато завилял хвостом.