Ответ:

Причастный оборот «нависшая над высокими вершинами тополей» стоит после определяемого слова «туча», поэтому выделяется запятыми.

Туча, нависшая над высокими вершинами тополей, уже сыпала моросящим дождиком.

Ответ: (1), (3) — запятые; (2), (4) — без знаков препинания.