Все они были покрыты (не)померно высокими крышами со множеством слуховых окон и отдушин.

Объяснение:
В данном предложении "непомерно" является наречием, которое можно заменить синонимом без "не" (например, "чрезмерно", "слишком"). Так как наречие с "не" может быть заменено синонимом без "не", оно пишется слитно.

Ответ: непомерно