Ответ:

  1. К утру буря утихла, и выглянуло солнце. Основы: «буря утихла» и «солнце выглянуло».
  2. Небо потемнело, но туча прошла стороной. Основы: «небо потемнело» и «туча прошла».
  3. Ветер усилился, и упали первые капли дождя. Основы: «ветер усилился» и «капли упали».

В каждом примере соединены части сложного предложения с разными грамматическими основами, поэтому перед союзом ставится запятая.