2. Нынче в пять часов утра когда я открыл окно моя комната наполнилась запахом цветов растущих в скромном палисаднике.

Нынче в пять часов утра, когда я открыл окно, моя комната наполнилась запахом цветов, растущих в скромном палисаднике.

Придаточная часть времени «когда я открыл окно» выделяется запятыми. Причастный оборот «растущих в скромном палисаднике» стоит после определяемого слова «цветов» и обособляется.

Схема: [ ..., (когда ...), ... цветов, |причастный оборот|].