Ответ:

Исправленный вариант: Не то дым шёл от костра, не то туман поднимался над болотом.

Грамматические основы: дым шёл; туман поднимался. Это сложносочинённое предложение с повторяющимся разделительным союзом не то… не то. Между частями перед второй частью союза ставится запятая.

Схема: Не то [— =], не то [— =].