Ответ:

По-прежнему было тепло и чувствовалась близость к земле, и по-прежнему медленно двигались в небе серые тучи, не угрожая дождём.

«По-прежнему» пишется через дефис. Запятая перед вторым «и» разделяет части сложного предложения; оборот «не угрожая дождём» обособляется как деепричастный.