хотя папа не причинил ?

Для решения задания необходимо вставить местоимение в соответствии с характеристикой, указанной после пропуска: 3 лицо, единственное число, женский род, дательный падеж. Под эти характеристики подходят местоимения ей.

В данном контексте наиболее подходящим является местоимение ей.

хотя папа не причинил ей ни малейшего зла, разве что затопил, бережно и осторожно.

Ответ: ей