(В)течение реки днём наблюдалось тревожное спокойствие. (Пишем окончание -е, так как это предлог с существительным в винительном падеже, отвечает на вопрос «в чём?»)
Правило дня: Чтобы правильно написать безударное окончание существительного, необходимо определить его склонение и падеж.