4. Стоянка неандертальцев Костёнки-1 был.. разработ.. в конце прошлого века.

Подлежащее «стоянка» женского рода, поэтому обе части сказуемого имеют форму женского рода.

Стоянка неандертальцев Костёнки-1 была разработана в конце прошлого века.