He asked her if she had seen her granny the day before.
Проверка за 10 секунд: "Did you see" меняется на "had seen", "your" меняется на "her", а "yesterday" меняется на "the day before".
Доп. профит: Читерский прием: Вопросы в прошедшем времени в косвенной речи требуют преобразования в Past Perfect.