В предложении два последовательных действия в прошлом: сначала команда обнаружила ископаемое, а затем отнесла его в лабораторию. Для первого действия используется Past Simple: 'found' (нашла). 'Had found' (нашла до какого-то другого действия в прошлом) или 'was finding' (находила в процессе) не подходят.
Ответ: found