Мы были в начальной школе с 1993 по 1998 год.
Ответ: were
Объяснение: Поскольку речь идет о периоде в прошлом (с 1993 по 1998), нужно использовать прошедшее время. Подлежащее 'We' (мы) во множественном числе, поэтому используем форму глагола 'to be' в прошедшем времени - 'were'.