3. На мостике появился лейтенант Михеев помощник командира катера.

На мостике появился лейтенант Михеев, помощник командира катера.

Сочетание «помощник командира катера» — распространённое приложение, стоящее после определяемого существительного «лейтенант Михеев», поэтому оно обособляется.

Ответ: На мостике появился лейтенант Михеев, помощник командира катера.