В правильной четырехугольной пирамиде основание ABCD — квадрат. Диагональ квадрата \( AC = 6 \).
В квадрате диагонали равны и точкой пересечения делятся пополам.
\( AO = OC = BO = OD = \frac{AC}{2} = \frac{6}{2} = 3 \).
Рассмотрим прямоугольный треугольник \( SOC \). Гипотенуза \( SC = 5 \), катет \( OC = 3 \). Нам нужно найти катет \( SO \).
По теореме Пифагора:
\[ SO^2 + OC^2 = SC^2 \]
\[ SO^2 + 3^2 = 5^2 \]
\[ SO^2 + 9 = 25 \]
\[ SO^2 = 25 - 9 \]
\[ SO^2 = 16 \]
\[ SO = \sqrt{16} = 4 \]
Таким образом, высота пирамиды \( SO = 4 \).
Ответ: 4.